2009年05月14日

Cytoscapeを使ってみた

オープンソースのbioinformatics向けソフトウェアプラットフォームで、ビジュアル化がすごい。
http://www.cytoscape.org/

ちょっと使ってみたが、インストールして約1時間でこんな図ができた。
cytecope-exam.jpg

これの元データは以下の感じ。
node32  pp      node33
node31  pp      node32
node22  pp      node23
node21  pp      node22
nod4    pp      nod5
nod3    pp      node31
nod3    pp      nod4
node12  pp      node13
node11  pp      node12
nod2    pp      node21
nod2    pp      nod3
nod1    pp      node11
nod1    pp      nod2
posted by tshibata at 23:55| Comment(0) | TrackBack(0) | Linux